نوع همکاری : همکار
کارفرما : پژوهشگاه دانش های بنیادی
سال طرح : 1393
مشاهده سایر طرح های آناهیتا نودهی
پیشرفت¬¬های غیر قابل انکار ابزارهای مدرن مسیر هموارتری را برای اخذ اطلاعات ارزشمند فراهم نموده است. لذا، به¬ نظر می¬رسد مسائلی که قبلا" بشر به¬دلیل ضعف تکنولوژی قادر به بررسی آن¬ها نبوده در عصر کنونی بتواند آنها را مورد مطالعه قرار دهد. با این¬حال، تکنولوژی موضوعات نوینی را همراه خود به ارمغان آورده است که جهت پاسخگویی به آنها استفاده از علوم مختلف ضروری است. یکی از موضوعات جدید و مورد توجه محققین علوم، بویژه علم ژنتیک و بیوانفورماتیک، پیشگویی ساختار پروتئین¬ها با تاکید بر ساختارهندسی و فضایی آن¬ها است. شبیه¬سازی دینامیکی مولکولی ابزاری مدرن برای این منظور می¬باشد که معمولا حجم بسیار زیادی از داده¬ها را در اختیار محققین زیستی قرار می¬دهد. تحلیل این حجم داده و سپس یافتن معیار مناسبی برای ارزیابی تغییرات در بین مجموعه داده¬ها از مسائل کلیدی این حوزه به¬شمار می¬رود. چون یکی از مشخصه¬های برجسته پروتئین¬ها زوایای دوسطحی مابین زوج اتم¬های متوالی است، می¬توان از آنها به عنوان مبنایی برای کشف تغییرات استفاده شود لذا کاهش بعد این داده¬ها که معمولا" حجم وسیعی دارند، نیازمند توجه خاصی است. از دیدگاه آمار شاید بتواند تحلیل مولفه اصلی، که عملکردش در مورد داده¬هایی از فضای اقلیدسی بی¬نظیر است، را به¬عنوان گزینه مناسب برای نیل به هر دو هدف تلقی کرد. اما، زاویه کمیتی در فضای نااقلیدسی است لذا، انتظار می¬رود ابزار سنتی و مرسوم تحلیل مولفه اصلی راجع به زوایای دوسطحی از اعتبار کافی برخوردار نباشد. اخیرا"، تکنیک¬های نوین کاهش بعد مثل تحلیل ژئودزیک اصلی و تحلیل قوس اصلی برای ارزیابی پراکندگی متغیرها در فضای نااقلیدسی معرفی شده¬اند. هدف اصلی تحقیق پیشنهادی حاضر، مطالعه امکان سنجی کاربرد چنین روش¬ها در مورد زوایای دوسطحی و استفاده از نتایج آن برای پیش-بینی مناسب¬تر ساختار پروتئین¬هاست.