بررسی مولکولار گونه های کمپلکس کاندیدا البیکنس (کاندیدا البیکنس، کاندیدا افریکانا و کاندیدا دابلینسیس ) در ایزوله های بالینی یاس
1398/10/24 09:24:01
نوع همکاری : همکار
کارفرما : مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی
سال طرح : 1397
مشاهده سایر طرح های محمد امین قطعی
مقدمه: عفونت کاندیدا جزء شایعترین عوامل بیماریزای قارچی است و سیر علائم بالینی از یک عفونت خفیف تا شدید و یک بیماری محدود شونده تا مزمن و عود کننده با درگیری مکان های مختف بدن متفاوت است. گونههای مختلف از مخمرهای جنس کاندیدا عامل بیماری میباشند ولی شایعترین گونه¬ی مسبب بیماری کاندیدا آلبیکنس است و میزان بروز سایر گونههای غیر آلبیکنس که معمولاً دارای مقاومت نسبت به آزول ها هستند در مطالعات و بررسیهای اخیر در حال افزایش میباشد. عفونت کاندیدا در شرایطی مثل نقص ایمنی، دیابت، حاملگی، مصرف کورتون و ... بروز بیشتری دارد. کمپلکس گونه کاندیدا آلبیکنس شامل کاندیدا آلبیکنس، کاندیدا آفریکانا و کاندیدا دابلینینسیس است که گونه کاندیدا آفریکانا گرچه از لحاظ ژنتیکی خیلی به کاندیدا آلبیکنس نزدیک است و بعضی آن را واریاسیون آلبیکنس می دانند ولی با توجه به کلامیدوسپور منفی بودن این گونه تفاوت واضحی با آلبیکنس دارد(فنوتیپ متفاوت در عین داشتن شباهت ژنی زیاد). گونه کاندیدا دابلینینسیس از لحاظ ژنتیکی متفاوت تر ولی شباهت فنوتیپی بیشتری به آلبیکنس دارد. هدف از این طرح شناسایی گونه های کمپلکس کاندیدا آلبیکنس با استفاده از توالی HWP1 است تا درک بهتری از میزان سویه های این کمپلکس که قبلا به عنوان آلبیکنس شناخته می شد بدست آید.
روش کار: 200 نمونه که از قبل از شهر یاسوج در سال 97-96 جمع آوری شده بودند و درون آب مقطر درون یخچال نگه داری می شدند روی محیط سابورد دکستروز آگار کشت داده شدند. برای استخراج DNA از نمونههای مخمری از روش گلاس بيد (Gloss-bead) فنل کلروفرم استفاده شد. ژن HPW1 توسط روش PCR تکثیر شد و تفریق گونههای نزدیک بهم کاندیدا آلبیکنس، کاندیدا دابلینینسیس و کاندیدا آفریکانا بر روی محصولات واکنش با استفاده از طول باندهای مختلف الکتروفورز صورت پذیرفت . قطعه تکثیر شده مورد انالیز سکونس برای تایید گونه قرار گرفت .
یافته ها و نتیجه گیری: در مطالعه انجام شده همانطور که گفته شد در ایزوله های بالینی جدا شده از 200 بیمار، 91 درصد ایزوله های جدا شده کاندیدا آلبیکنس و 9 درصد دیگر کاندیدا آفریکانا بود و هیچ موردی از دابلینینسیس دیده نشد. این میزان شیوع از کاندیدا آفریکانا از سایر مطالعات انجام شده بیشتر بود که در صورت نیاز می توان با مطالعات گسترده تر کلی تر بودن این اطلاعات را بررسی کرد به علاوه اینکه هیچ موردی از دابلینینسیس دیده نشد. بیشترین شیوع سنی از اطلاعات موجود در هر دو گونه سن 30 تا 40 سال بود که این شیوع در کاندیدا آفریکانا برجسته تر است ولی با این حال این ارتباط معنی دار نبود. خانه دارها بیشترین جمعیت را از لحاظ فراوانی هر دو گونه داشتند که می تواند به علت بیشتر بودن وضعیت شغلی خانه داری خانم ها در منطقه باشد یا اینکه ارتباط حقیقی با خانه داری وجود دارد. از طرف دیگر شاید نبودن گونه کاندیدا آفریکانا در گروه آرایشگران نکته دیگری باشد. در ارتباط گونه با وضعیت پیشگیری از بارداری گرچه اکثریت موارد شامل روش های طبیعی و نداشتن روش پیشگیری بودند ولی میزان بسیار پایین کاندیدا آفریکانا در مصرف کنندگان قرص های پیشگیری از بارداری و بیشتر بودن در افراد استفاده کننده از وسایل مثل IUD و کاندوم برجسته تر بود. در ارتباط گونه با بیماری زمینه ای تمامی موارد کاندیدا آفریکانا در افراد بدون بیماری زمینه ای بود ولی کاندیدا آلبیکنس گرچه عموما در افراد بدون بیماری زمینه ای دیده شد ولی تعدادی از بیماران دیابت یا روماتیسم داشتند.