مطالعه مبتنی بر رایانه در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با مقاومت به ریفامپین بالا : مطالعه ساختاری بر پایه فارماکوفور

سل یک بیماری عفونی است که توسط مایکوباکتریوم سل ایجاد می شود. تعداد بیماران مبتلا به MDR-TB در سراسر جهان در حال افزایش است. مقاومت در برابر داروهای ضد سل عمدتا به دلیل جهش های خود به خودی در ژنوم سل است. ریفامپین (RIF) یکی از مهمترین عوامل درمانی است که در درمان سل مورد استفاده قرار می گیرد. RIF به زیر واحد بتا RNA پلیمراز که توسط ژن RpoB رمزگذاری می شود ، متصل می گردد و همچنین رونویسی را مهار می کند. مقاومت به ریفامپین به دلیل جهش در پروتئین زیر واحد بتا RNA پلیمراز (RpoB) است. RpoB شامل یک منطقه تعیین کننده مقاومت به ریفامپیسین (RRDR) است و چندین مکان قوی برای جهش دارد. درک مکانیسم های ساختاری درگیر در مقاومت RIF ممکن است به کشف و طراحی مولکول های جدید برای درمان سل مقاوم در برابر ریفامپین کمک کند. این نوع اطلاعات ساختاری برای درک بهتر مکانیسم های مولکولی جهش های ایجادکننده مقاومت و تلاش برای طراحی بر اساس ساختار دارو مهم هستند. در این مطالعه ، سایتهای مختلف جهش درگیر در مقاومت RIF بررسی شدند. شبیه سازی دینامیک مولکولی بر روی ساختارهای پروتئین نوع وحشی و جهش یافته و تجزیه و تحلیل ساختاری مختلف برای روشن کردن رفتار پویای اشکال نوع وحشی و جهش یافته صورت گرفت. داینامیک تفاوت اساسی در انعطاف پذیری انطباقی و حالت جمعی حرکت بین نوع وحشی و جهش یافته را نشان داد. این مطالعه تجزیه و تحلیل جامعی از اتصال RIF به RpoB جهش یافته و نوع وحشی را فراهم می کند.