آنالیز تنوع باکتریایی همزیست اسفنج های جمع آوری شده از خلیج فارس با روش Pyrosequencing

سابقه و هدف: اسفنج های دریایی منبع غنی از ترکیبات دارویی و بیوتکنولوژیکی جدید هستند. این ترکیبات به وسیله خود اسفنج ها و یا به طور معمول توسط باکتری های همراه اسفنج ها ساخته می شوند. این مطالعه با هدف ارزیابی تنوع باکتری های همزیست اسفنج ها با استفاده از روش 454 پایروسکوئنسیگ در ایران انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه تعداد 10 گونه مختلف اسفنجی با روش SCUBA از قسمت های مختلف خلیج فارس (بوشهر، دیر، عسلویه) جمع آوری گردید. پس از استخراج DNA با روش CTAB، تنوع باکتریایی این اسفنج ها با استفاده از روش 454 پایروسکوئنسیگ مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته ها: اسفنج های مورد بررسی بر اساس ترکیب باکتریایی خود به 7 گروه تقسیم بندی شدند. این 7 گروه از الگوی باکتریایی مشابهی از نظر شاخه و سطوح طبقه بندی پایین تر برخوردار بودند. منحنی های شاخص تنوع و فراوانی تجمعی رتبه ای نشان دهنده ترکیبات مختلفی از جوامع باکتریایی در گروه های اسفنج ها بود. نتایج به دست آمده در این مطالعه نشان داد که در مجموع خوانش های مربوط به شاخه سیانوباکتریا و پروتئوباکتریا به طور غالبی (2/1- 4/81 درصد) و (3/8- 8/60 درصد) در تمام اسفنج ها وجود داشته است. و به دنبال آن ها به ترتیب شاخه های کلروفلکسی (8/10 درصد)، اسیدوباکتریا (7/7 درصد) و اکتینوباکتریا (7/5 درصد) قرار داشتند. همچنین برخی از اسفنج ها دارای فراوانی بالایی از گروه های باکتریایی ناشناخته (به عنوان مثال بیش از نیمی از تاکسا در سطح خانواده) بودند که با روش مستقل از کشت به دست آمده بودند. نتیجه گیری: این مطالعه برای اولین بار در ایران موفق به شناسایی باکتری های همزیست اسفنج های خلیج فارس گردید. واژگان کلیدی: اسفنج، تنوع باکتریایی، 454 pyrosequencing، خلیج فارس.