پروتئین NPR1 در سیستم مقاومت اکتسابی گیاهان (SAR) نقش اساسی دارد. این پروتئین با اتصال به TGA (فاکتور رونویسی) باعث تظاهر ژن PR1 به عنوان ژن مقاومت می‌شود. این بررسی با هدف مقایسه ساختار این پروتئین در گونه‌های مختلف گیاهی صورت گرفت. جهت جمع‌آوری اطلاعات اولیه پروتئین NPR1 در گیاه آرابیدوپسیس از سایت TAIR استفاده شد. در آرابیدوپسیس این پروتئین دارای 593 اسیدآمینه است. برای آنالیز حوزه‌ها از سایت Expasy استفاده گردید. با روش BLASTp در سایت NCBI و Uniprot 20 پروتئین مشابه در سایر گونه‌ها انتخاب شده و تطابق چندتایی با نرم افزار T-Coffee صورت گرفت. ترسیم درخت فیلوژنی 20 گونه منتخب با نرم‌افزار Mega4 انجام شد. نتایج نشان داد که در حوزه BTB/POZ، گیاه ذرت دارای بیشترین اختلاف با سایر گونه‌ها بود. در سیستئین شماره 82 و 216 که در تشکیل اتصالات دی‌سولفیدی نقش دارند و سیستئین شماره 521 و 529 که در اتصال به یون فلزی اهمیت دارند، اختلافات اساسی بین گونه‌ها وجود داشت. رسم درخت فیلوژنی 4 گروه را در میان گونه‌ها آشکار ساخت که گیاه ذرت به تنهایی در یک گروه قرار گرفت.
کلید واژگان :تطابق چندتایی، پروتئین مقاومت، درخت فیلوژنی، مقاومت اکتسابی
ارزش ریالی : 300000 ریال
با پرداخت الکترونیک
جزئیات مقاله
- کد شناسه : 6148394369767704
- سال انتشار : 1395
- نوع مقاله : مقاله کامل پذیرفته شده در کنفرانس ها
- زبان : فارسی
- محل پذیرش : همایش ملی یافته های پژوهش و فناوری در اکوسیستم های طبیعی و کشاورزی
- برگزار کنندگان : پژوهشکده انرژی های نو و محیط زیست
- تاریخ ثبت : 1395/10/20 10:04:57
- ثبت کننده : زین العابدین شهادتی مقدم
- تعداد بازدید : 166
- تعداد فروش : 0