ماهی آزاد دریای خزر (Salmo trutta caspius) از نظر کیفیت گوشت، ارزش اقتصادی و حفظ ذخیره ژنتیکی از اهمیت زیادی برخوردار است. در این مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت ماهی آزاد دریای خزر مهاجر به رودخانه کرگانرود با استفاده از روش ریز ماهواره مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور در پاییز و زمستان سال 1390 تعداد 47 عدد مولد ماهی آزاد با استفاده از تور سالیک و دام از رودخانه کرگانرود در استان گیلان صید و حدود 5-3 گرم از بافت نرم و تازه انتهای باله ماهی جدا و در الکل اتانول °96 تثبیت و به آزمایشگاه ژنتیک پژوهشکده اکولوژی دریای خزر (ساری) منتقل گردید. DNA ژنومی به روش استات آمونیوم استخراج و کمیت و کیفیت آن با استفاده از روشهای اسپکتروفتومتری و الکتروفورز افقی ژل آگارز 1% تعیین شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از 16 جفت آغازگر ریز ماهواره انجام و محصولات آن روی ژل پلی اکریل آمید 6% الکتروفورز و با استفاده از روش نیترات نقره رنگ آمیزی شدند. باندهای حاصل با استفاده از نرم افزار Photo- Capt امتیازدهی شدند و تجزیه و تحلیل آماری داده ها با استفاده از نرم افزارهای Gene Alex و Pop Gene انجام پذیرفت. 5 جفت از آغازگرها تولید باندهای چندشکلی نمودند. میانگین تعداد آللهای واقعی و مؤثر به ترتیب 75/1±60/7 و 32/1±48/5 و میانگین هتروزایگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار به ترتیب 11/0±50/0 و 13/0±70/0 محاسبه شد و انحراف از تعادل هاردی- واینبرگ در بیشتر جایگاه ها مشاهده گردید (P< 0.001) که می تواند به علت حضور آللهای نول و وجود آمیزش های خویشاوندی باشد.
