كپوردندان زاگرس (Aphaniusvladykovi) گونهاي كوچك و داراي ارزش بيولوژيكي است. اين ماهي بومي ايران در استان چهارمحال و بختياري بوده و در چشمهها و تالابهاي اين استان زندگي ميكند. در اين پژوهش، جهت بررسي تنوع ژنتيكي اين گونه، نمونه برداري از دو منطقه تالاب گندمان و شلمزار، 23عدد از هر منطقه، انجام شد. 5جفت آغازگر ريزماهواره جهت بررسي تنوع ژنتيكي مورد استفاده قرار گرفت كه 100%، چندشكلي نشان دادند. ميانگين هتروزيگوسيتي مشاهده شده برابر 965/0محاسبه شد كه از ميانگين هتروزيگوسيتي قابل انتظار (867/0) بيشتر است. ميانگين جريان ژني و ضريب درون آميزي به ترتيب برابر 33/23و 11/0-به دست آمد. نتايج حاصل از Fst(1%) و Rst(14%) تمايز ژنتيكي بسيار پائين و تنوع درون جمعيتي مناسبي را بين دو جمعيت نشان داد. آناليز واريانس ملكولي 1%تمايز بين جمعيتها و 99%تنوع درون جمعيتي نشان داد. فاصله ژنتيكي بين جمعيتها 236/0محاسبه شد. در بررسي تعادل هاردي ـ واينبرگ از ميان 10تست جايگاه ژني، در 5تست، پيروي از تعادل مشاهده شد.
